Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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