Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpc4P51655 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms