Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Epb42P49222 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Epb42P49222 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms