Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syt1P46096 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syt1P46096 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms