Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tac1P41539 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms