Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa10P31310 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms