Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msr1P30204 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msr1P30204 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms