Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms