Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nfkb1P25799 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms