Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Edn1P22387 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms