Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb1P17919 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb1P17919 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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