Protein–RNA interactions for Protein: P14211

Calr, Calreticulin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalrP14211 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CalrP14211 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CalrP14211 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CalrP14211 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CalrP14211 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CalrP14211 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms