Protein–RNA interactions for Protein: P11499

Hsp90ab1, Heat shock protein HSP 90-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsp90ab1P11499 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hsp90ab1P11499 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hsp90ab1P11499 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms