Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fv4P11370 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fv4P11370 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fv4P11370 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fv4P11370 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms