Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms