Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc8P09025 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc8P09025 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms