Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TtrP07309 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtrP07309 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TtrP07309 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TtrP07309 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtrP07309 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TtrP07309 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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