Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gap43P06837 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gap43P06837 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms