Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Ab1P01921 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms