Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccl20O89093 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccl20O89093 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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