Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnnal1O88327 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms