Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EdaO54693 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EdaO54693 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EdaO54693 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EdaO54693 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EdaO54693 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms