Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FxnO35943 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FxnO35943 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FxnO35943 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FxnO35943 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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