Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CaluO35887 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CaluO35887 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms