Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Klf9O35739 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Klf9O35739 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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