Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc1a6O35544 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms