Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-ObO35424 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
H2-ObO35424 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms