Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm20828J3KMI7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20828J3KMI7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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