Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arfgef1G3X9K3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms