Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms