Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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