Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm9887F6RFI0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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