Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms