Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtproE9Q612 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms