Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx60E9PZQ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms