Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apba1B2RUJ5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms