Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Brpf3B2KF05 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms