Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trabd2bB1ATG9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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