Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M5A7VMS3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.1 ms