Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc183A2AJB1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc183A2AJB1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms