Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HnrnpcQ9Z204 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HnrnpcQ9Z204 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HnrnpcQ9Z204 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HnrnpcQ9Z204 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms