Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx39bQ9Z1N5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx39bQ9Z1N5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms