Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NgfrQ9Z0W1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms