Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apobec2Q9WV35 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec2Q9WV35 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms