Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 564.8 ms