Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plod1Q9R0E2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms