Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ChmQ9QXG2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms