Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cln8Q9QUK3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms