Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod2Q9JKK7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Tmod2Q9JKK7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmod2Q9JKK7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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