Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppp2r3cQ9JK24 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms